مقایسه بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی به کلاریترومایسین با استفاده از روش های Multiplex PCR و Real-Time PCR

مقدمه و هدف: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس و مایکوباکتریوم غیرسلی می توانند در عفونت های شدید ریه، پوست یا بافت نرم دخیل باشند. ماکرولیدهایی مانند کلاریترومایسین داروهای خط اول توصیه شده برای درمان عفونت های مایکوباکتریومی هستند. با این حال، مایکوباکتریوم های سلی و غیرسلی دارای مکانیسم های دوگانه مقاومت در برابر ماکرولیدها است که درمان با ماکرولیدها را دشوار می کند. هدف از این مطالعه مقایسه بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی به کلاریترومایسین با استفاده از روش های Multiplex PCR و Real-Time PCR می باشد. روش کار: ما یک روش Real-time PCR برای تشخیص مقاومت القایی و اکتسابی به کلاریترومایسین ایجاد کرده‌ایم و نتایج را با روش Multiplex PCR برای ژن erm و rrl مقایسه کردیم. همچنین در این مطالعه سویه های حساس به کلاریترومایسین و سویه مقاوم به کلاریترومایسین با دو روش Multiplex PCR و Real-Time PCR آنالیز شدند. همچنین وجود حذف در erm و rrl توسط Multiplex PCR و Real-Time PCR تشخیص داده شدند. نتایج: از مجموع جدایه های مایکوباکتریومی آزمایش شده، erm در 18.3 درصد از نمونه ها دارای دو جهش در ژن erm بود. همچنین یک جهش A2058C اکتسابی در rrl دیده شد. نتایج Multiplex PCR با نتایج Real-Time PCR در 96 درصد نمونه ها همبستگی داشت. آزمایش Multiplex PCR در مقایسه با Real-Time PCR 2 مورد از این اختلافات را با نشان دادن وجود هر دو آلل erm در جدایه هایی که در روش Multiplex PCR از دست رفته بود، برطرف کرد. طبق بررسی ها بین نتایج Multiplex PCR و Real-Time PCR ناسازگاری داشتند. فرض بر این بود که 3 جدایه اختلاف بین Multiplex PCR و Real-Time PCR را نشان دادند، 2 مورد دیگر هر دو آلل را با استفاده از Real-Time PCR شناسایی کردند که منجر به 100% تطابق در مقایسه با Multiplex PCR شد. نتیجه گیری: در نتیجه، Real-Time PCR برای تشخیص مقاومت به کلاریترومایسین اکتسابی و القایی دقیق‌تر است، به‌ویژه زمانی که پروفایل‌های ژنیک مختلط در یک نمونه وجود دارد.